近年来，随着温室大棚蔬菜连年种植和复种指数的不断提高，土壤结构越来越差，导致根部病害逐年增加，根部病害是导致作物死苗的主要原因。
常见的根部病害
1.根腐病
根腐病是低温高湿病害，定植后至初冬均可发生，呈矮化萎缩状，下部老叶叶缘变紫红色或紫褐色，逐渐向上扩展，全株萎蔫或枯死。根系比健康植株根系短小，颜色灰暗，地下部不定根大量死亡，新生根受到病原菌的侵害，生长稀疏。
2.沤根
造成沤根的主要原因是浇水过大，土壤水分过高，或地温低于12℃持续时间长，再加上遇连阴雨天气，根系长期处在缺氧的环境，使根系窒息死亡。
沤根主要在外观形象是植株锈住不长，叶片深绿色，叶片周边一般有黄边，拔出观察，不生新根，根的颜色为褐色，严重时根的表皮易脱落，与根腐病相比，植株出现萎蔫时较晚。但这种生理性病害（障碍）如果不及时采取措施，极易演变成侵染性病害。如果沤根持续时间长，土壤中腐生的茄病镰孢侵染后就会发展成镰刀菌根腐病；当土壤中腐生的腐霉菌侵染后也会变成根腐病。
3.黑根病
黑根病是由螺壳状丝囊霉侵染引起的，发病初期程立枯病症状，中后期地上部萎蔫枯黄，根部全都腐坏变褐变细，主根常从近地面处折断。
4.红根病
红根病主要危害植株根部和茎基部，病菌从伤口侵入；发病初期病部出现水渍状红褐色斑点，以后变为暗褐色或黑褐色，稍凹陷或开裂；主根腐烂或坏死，侧根稀少，植株矮化，容易拔出。严重时主根全部腐烂，茎叶枯死。
根部病害难防治原因
1.病害种类多。
为害蔬菜根部、根茎部，造成死棵的病害有黄萎、枯萎、立枯、灰霉、茎基腐、根腐等十几种，有卵菌、真菌、细菌和线虫之分。不同病害要求不同的防治方法和不同农药。菜农很难对这些作全面了解，也就难以区别对待采取恰当的防治措施，包括综合防治和选择更有效的农药。
2.重茬严重。
绝大多数大棚种的蔬菜品种较单一，很多大棚改茬换茬难以办到。所以，除由重茬造成的产量、质量降低外，还会使病害一年年增多，发病一年年加重，尤以根部病害更为明显。
3.很难及时发现病害。
根部病害发病部位不可见，都是在土壤中，而我们不可能观察土壤中根系到底是什么状况，所以根部病害发生后很难发现。而我们平时判断作物是否发生根部病害，主要依据就是地上部叶片颜色以及是否萎蔫，但是这种表现症状往往不会在刚发病时表现出来。
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